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Rejoignez le groupe des EOSC FAIR Champions !

Devenez l’un des 12 “EOSC FAIR champions” pour le projet européen FAIR-IMPACT (Expanding FAIR solutions across EOSC). Le rôle des FAIR champions est d’agir comme ambassadeurs du FAIR auprès de leur communauté et de promouvoir les résultats du projet. Ils peuvent aussi s’impliquer dans l’organisation d’événements autour du projet au niveau national (national roadshows). Une expérience enrichissante et l’occasion de faire de nombreuses rencontres.

Les candidatures sont ouvertes jusqu’au 10 mars. Plus des détails ci-dessous et sur le site du projet.


Are FAIR policy & practices within your expertise? Do you have communication skills? Does it excite the idea of mobilising others to generate more FAIR data? FAIR-IMPACT gives you room to boost the sharing of FAIR data best practices across different disciplines, by joining the group of EOSC FAIR Champions.

The EOSC (European Open Science Cloud) FAIR Champions will be composed by highly visible experts actively engaged in analysing and shaping FAIR data policies and practices in their field. Each champion is engaged in identifying research data gaps and needs within their communities, to create broader engagement with FAIR, and to shape and disseminate the outcomes of the FAIR-IMPACT project.

To become yourself a FAIR Champion, fill in the form available at this page by 10th March 2023 17:00 CET. By becoming a Champion you will have the opportunity to:

  • Shape the development and implementation of standards for data management in your discipline, that will allow the development of customised solutions for your “community” needs;
  • Join a group of inspired influencers in shaping FAIR data policies and practices;
  • Be a driver of competences and capacity in FAIR data principles uptake;
  • Facilitate the organisation of a FAIR-IMPACT National workshop in your country;
  • Contribute to reports on EOSC Governance by sharing your needs/challenges/ requirements.

What would be expected from you as a member? Some of the activities envisaged from the Champions are actively engaging with their community on FAIR-IMPACT developments, participating in webinars as invited speakers, joining events in Europe, meeting periodically through conference calls, amongst others.

More information about this call is available here. Do not hesitate to contact the FAIR-IMPACT team if you need further info. Looking forward to hearing from you soon.

Votre avis sur la lettre d’information RDA-France-FAIR

La lettre RDA-France-FAIR, initiée par le projet FooSIN en collaboration avec RDA France, fêtera bientôt ses 2 ans.

Nous souhaiterions en savoir plus sur la manière dont la communauté la perçoit et l’utilise.

Que vous soyez lecteur régulier ou ponctuel, nous vous invitons à vous rendre à cette adresse* et à répondre aux 8 questions. Cela ne vous prendra que quelques minutes.

Ce sondage restera ouvert jusqu’au 15 septembre. Il n’est pas nominatif.

Retrouvez les archives de la lettre sur le site RDA.

Enquête AgBioData : les entrepôts de données génomiques, génétiques et de sélection sont-ils FAIR ?

Le Consortium AgBioData (https://www.agbiodata.org) invite les utilisateurs des banques de données suivantes :

Agbase, AgroPortal, Alfalfa Breeders Toolbox, Animal QTLdb, Bovine Genome Database, CassavaBase, Citrus Genome Database, CottonGen, CyVerse, EBS (Enterprise Breeding System), Genome Database for Rosaceae, Genome Database for Vaccinium, GOBii, GrainGenes, Gramene, GRIN, Hardwood Genomics, Hymenoptera Genome Database, i5k Workspace@NAL, KitBase, Legume Information System, MaizeGDB, MusaBase, National Animal Disease Center, PeanutBase, Planteome, Pulse Crop Database, Sol Genomics Network, SorghumBase, SoyBase, SweetPotatoBase, TAIR, TreeGenes, Triticeae toolbox, T3, YamBase

à répondre à une enquête concernant les pratiques de curation des données génomiques et génétiques et leur amélioration au bénéfice des programmes de recherche et de sélection agricole.

L’enquête prend une dizaine de minutes. Elle est anonyme et vos réponses seront utilisées pour définir les futurs objectifs et solutions d’AgBioData en matière de gestion des données dans le secteur agricole.

Si vous êtes prêt à participer, veuillez soumettre vos réponses ici avant le 9 mai 2022.

 

Info Formation “FAIR data : Science Ouverte et PGD »

Dna, docteur, laboratoire, hélix, la biologie, génétique, code, science, Genome, Chromosomes, gène, la vie, médical, information, rapport, aide, recherche, microbiologie, médicament, santé, illustration, dessin animé, Police de caractère, art, conception graphique, animation, sourire, personnage fictif, style, Images Gratuites In PxHereLes plateformes  ARTbio, Migale, PlantBioinfoPF, l’Institut Français de Bioinformatique et l’Institut Pasteur Paris organisent une édition Francilienne de la formation “FAIR data : Science Ouverte et PGDComment gérer des jeux de données haut-débit en sciences de la vie et de la santé” en présentiel à Paris (campus Sorbonne Université),  les 22 et 23 Mars 2022.

Cette formation s’adresse à l’ensemble des personnels scientifiques confrontés à la gestion de jeux de données en sciences de la vie et de la santé et souhaitant mettre en œuvre les principes « FAIR » tout au long du déroulement d’un projet. La formation abordera les différents points fondamentaux (théoriques, pratiques, juridiques) en lien avec la politique nationale d’ouverture des données de la recherche. Elle présentera sous forme de séances pratiques et interactives les ressources accessibles à la communauté scientifique, en particulier dans le domaine des sciences de la vie et de la santé, ainsi que les solutions proposées par l’IFB pour gérer les données d’un projet de recherche.

Cette session est ouverte à tout public, sans pré-requis ni expérience préalable d’outils de gestion de jeux de données, mais souhaitant monter en compétences sur cette thématique. Toutefois, pour cette session Francilienne, la priorité sera donnée au parisiens et aux régions parisiennes. 

Les inscriptions sont gratuites mais obligatoires. Il faut remplir le formulaire suivant au plus tard pour le 1er mars prochain :

INSCRIPTION À LA FORMATION FAIR DATA

EN SAVOIR PLUS SUR LA FORMATION

Rapport FooSIN sur les formations en relation avec les principes FAIR

Le rapport sur les formations FAIR (D3.1) réalisé dans le cadre du projet FooSIN est disponible (https://hal.inrae.fr/hal-03260886). Les résultats (47 enregistrements) proviennent d’une enquête menée au second semestre 2020 auprès des organisations partenaires du projet, complétée par une recherche sur Internet. Le rapport identifie les actions de formation en rapport avec les principes FAIR et met en lumière les sujets peu ou pas traité, à savoir :

  • Nettoyage des données,
  • Web sémantique, linked data,
  • Ontologies, vocabulaires,
  • Implémentation des principes dans un domaine particulier,
  • Open source (forges logicielles),
  • Services web, API.

Classement des sujets selon leur nombre d’occurrences sur l’ensemble des formations

L’étude s’intéresse à d’autres aspects : généricité vs spécificité au domaine, modalité et durée des formations, langue, niveau des pré-requis et type de contenu. En savoir plus.

 

Métadonnées minimales pour les ressources sémantiques

L’atelier organisé par le projet FAIRsFAIR le 4 juin dernier a rassemblé plus de 70 experts intéressés par l’harmonisation et la normalisation des métadonnée pour les ressources sémantiques. La communauté Agriculture/Alimentation utilise plusieurs portails de ressources sémantiques de manière alternative ou complémentaire. L’interopérabilité de ces portails de ressources sémantiques est une question importante pour FooSIN. 3 membres du projet ont participé à cet atelier.

L’objectif de l’atelier était de travailler spécifiquement la recommandation P-Rec 3: « A common minimum metadata schema must be used to describe semantic artefacts and their content. », issue de « FAIR Semantics recommendations» dont la seconde version a été publiée en janvier 2021 et ouverte aux commentaires en ligne.

La solution envisagée s’appuie sur DCAT 2.0 (Data Catalog Vocabulary), cette nouvelle version publiée en 2020 permettant de décrire toute ressource référençable dans un catalogue, les relations entre les ressources ainsi que les services autour des données

  • Louiz Bonino (Univ Twente/GO FAIR) a donné une rapide introduction DCAT 2.0 ;
  • Clément Jonquet (LIRMM, Univ Montpellier, partenaire FooSIN) a présenté MOD2, une extension de DCAT pour les ressources sémantiques (en savoir plus) et le travail réalisé dans le groupe de travail RDA Vocabulary and Semantic Services

La séance a permis aux participants de s’exprimer à l’aide de sondages pour identifier l’ensemble minimal des métadonnées utiles afin d’initier un profil DCAT adapté aux ressources sémantiques.

Découvrir les travaux de FAIRsFAIR autour de Sémantique, intéropérabilité et services.
S’abonner à la newsletter FAIRsFAIR pour être informé des prochains ateliers

Appel à témoin : Racontez votre expérience d’utilisation d’AGROVOC

AGROVOC a 40 ans ! La FAO souhaite recueillir des expériences sur la façon dont AGROVOC est utilisé et par qui. Les organisations qui utilisent le thésaurus AGROVOC sont invitées à raconter comment le plus grand ensemble contrôlé de concepts agricoles au monde a fait la différence dans leur travail.

Vous pouvez envoyer avant le 17 juin un texte (300 mots) ou une courte vidéo en anglais décrivant qui vous êtes et comment votre organisation interagit avec le thésaurus agricole de la FAO.

Les cas les plus intéressants pourront être présentés lors du « AGROVOC Annual Event » qui aura lieu le 29 Juin 2021.

Accès à l’appel : http://www.fao.org/agrovoc/fr/news/call-case-studies-tell-us-about-your-experience-using-agrovoc 

5ème lettre RDA-France-FAIR : Événements, lecture et appel à manifestation d’intérêt

Cette lettre et les précédentes sont consultables en ligne sur le site de la Research Data Alliance à cette adresse.

Pour recevoir les prochaines lettres, abonnez-vous ici.

La lettre n°5 contient :

Événements

  • 28 mai 2021, 1h du matin: “Versioning Data Is About More than Revisions: A Conceptual Framework and Proposed Principles”, présentation des résultats du Groupe de Travail RDA Data Versioning.
  • 4 juin, 9h30: Atelier “Common Minimum Metadata for Semantic Artefacts”, organisé par le projet FAIRsFAIR.
  • 15-18 juin 2021: EOSC Symposium 2021
  • 28 juin 2021, 14h: Atelier RDA France sur les travaux et les propositions du Groupe de Travail RDA FAIR for Research Software, animé par Morane Gruenpeter

A lire !

  • “A Controlled Vocabulary and Metadata Schema for Materials Science Data Discovery”, et “Implementing a Registry Federation for Materials Science Discovery”, résultats du Groupe de Travail International Materials Resource Registry de la RDA.

Appel à manifestation d’intérêt

  • Participation à des tests du RDA FAIR Data Maturity Model organisés par RDA France.

Lire la 5ème lettre RDA-France-FAIR.

Faites connaître la liste dans vos réseau en transmettant la lettre ou en invitant d’autres personnes à s’abonner  : https://listes.services.cnrs.fr/wws/subscribe/rda-france-fair?previous_action=info

Affiche « Cycle de vie des données : un outil pour améliorer la gestion, la mise en qualité et l’ouverture des données »

Au sein du département scientifique « Sciences pour l’action, les transitions, les territoires »  d’INRAE, des spécialistes de la qualité des données (chantier QualiNous) d’une part et du règlement général sur la protection des données (RGPD) d’autre part, se sont associés pour créer une affiche qui permet d’appréhender le cycle de vie des données en vue d’améliorer la gestion, la mise en qualité et l’ouverture des données de la recherche :

Veronique Batifol, Laurent Burnel, Aurélie Cardona, François Johany. Affiche « Cycle de vie des données : un outil pour améliorer la gestion, la mise en qualité et l’ouverture des données ». 2021, ⟨10.15454/hsc3-b796⟩⟨hal-03204351⟩

 

FooSIN a souhaité partager avec vous cette affiche qui met les principes FAIR au cœur de la démarche de la gestion et de la réutilisation des données. A destination des agents INRAE, les recommandations font certes références à des ressources qui leur sont réservées mais peuvent être source d’inspiration pour tous.

Cette affiche a pour objectif de permettre aux producteurs et gestionnaires de données :

  1. D’appréhender le cycle de vie des données, comme un processus pendant lequel une ou plusieurs personnes interagissent avec les données, de leur création à la publication jusqu’à leur réutilisation ultérieure ;
  2. De repérer les différentes étapes clés de la gestion/mise en qualité/ouverture des données tout au long d’un projet de recherche ;
  3. D’identifier un certain nombre d’outils et de ressources associés aux différentes étapes du cycle de vie pour aider à la gestion des données de la recherche, leur mise en qualité et ouverture. Cette ouverture pouvant se faire dans différents périmètres : du partage dans le collectif du projet jusqu’à l’open data ;
  4. D’identifier pour les données à caractère personnel (DCP) un certain nombre d’actions à mettre en place pour garantir leur mise en conformité avec le Règlement Général pour la Protection des Données (RGPD).

En complément des recommandations faites par les auteurs, FooSIN suggère aux gestionnaires de données qui souhaitent mieux répondre aux principes FAIR d’utiliser :

  • des standards reconnus par leur communauté pour représenter les données, éventuellement des ontologies ;
  • des vocabulaires contrôlés pour les valeurs de propriété ;
  • des catalogues et entrepôts qui mettent en œuvre des schémas de métadonnées standards et les web services permettant de les exploiter.

Ces types de ressources permettent de clarifier voire d’expliciter de manière formelle la sémantique des données et des métadonnées, facilitant ainsi leur découverte (F) et leur réutilisation (R). Pour agir sur l’interopérabilité (I) entre deux jeux de données, deux scénarios possibles :

  • utiliser les mêmes schémas de données et/ou de métadonnées
  • déclarer des correspondances (alignements) entre les schémas de données et/ou de métadonnées utilisés respectivement

Des catalogues comme FAIRsharing, RDA Metadata Directory, Agroportal, Bioportal, etc. permettent de choisir ce type de ressources partagées pour les réutiliser.

 

4ème lettre RDA-France-FAIR : Evénements, outils, lectures et formations autour des principes FAIR

Cette lettre et les précédentes sont consultables en ligne sur le site de la Research Data Alliance à cette adresse.

Pour recevoir les prochaines lettres, abonnez-vous ici.

La lettre n°4 contient :

Événements

  • 11 mai à 14h – Webinaire RDA France sur la plateforme nationale fédérée des données de la recherche.
  • 26 mai 14h – 15h Webinaire du projet FAIRplus: “Discovering the FAIR Cookbook
  • 21-23 juin : FAIR Festival 2021, organisé par GO-FAIR, en distanciel

Outils

  • L’Université de Montpellier propose son modèle de Plan de Gestion de Données
  • Entrepôt de données Dataverse :  Martine Barale présente “La gestion et la valorisation des données de recherche : l’exemple du Dataverse du Cirad”
  • Les plans de gestion des données sont référençables dans ORCID

A lire !

  • “Qu’est-ce que le travail scientifique des données ? Big data, little data, no data” – la traduction en français du livre de référence de Christine Borgman
  • Livre blanc sur “Research Data : The Future of FAIR”
  • “Comment rendre son logiciel plus FAIR” par le blog Open Science de l’Institut Pasteur

Se former

  • du 14 au 17/6 : cours sur “Best practices in research data management and stewardship” dans le domaine biomédical, proposé par Elixir Luxembourg
  • Découvrez les modules d’auto-formation de DoRANum 
  • Un aperçu des principaux parcours de formation et ressources pédagogiques dans les domaines de la gestion des données et de la Science Ouverte, par le projet FAIRsFAIR

Lire la 4ème lettre RDA-France-FAIR.

Faites connaître la liste dans vos réseau en transmettant la lettre ou en invitant d’autres personnes à s’abonner  : https://listes.services.cnrs.fr/wws/subscribe/rda-france-fair?previous_action=info